不完全不准确不系统的计算模拟入坑记录
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不完全不准确不系统的计算模拟入坑记录
本文档是一个菜鸡的上课笔记和实践踩坑的一些记录。
课程为学不会系列之《能源环境材料计算模拟方法》,授课教师四川大学岑望来副研究员。
教学大纲:
- 绪论(3 学时):介绍计算模拟方法在能源环境材料研究与开发中的应用情况,理论与方法体系,课程安排和考核办法,Windows 系统下个人电脑计算模拟软件安装与调试。
- Linux 操作系统基础(6 学时):服务器系统结构,权限,用户管理,文件管理;vi 编辑器使用方法。
- Materials Studio 软件使用基础(6 学时):Materials Studio 软件介绍及其 Visualizer 模块的使用方法;CASTEP 模块使用方法;分别以 O2 分子和 NaCl 晶体结构优化为例作操作练习。
- VASP 软件基础(6 学时):VASP 软件介绍,分别以 O2 分子和 NaCl 晶体结构优化为例作操作练习。
- 结构化学基础(3 学时):介绍点群、晶体对称性、晶面和倒空间;介绍原子和分子电子结构;用 Materials Studio 做晶面建模练习。
- 电子结构理论及计算方法(12 学时):自洽场理论、能带理论、态密度、电荷密度;自旋电荷密度分析,电荷密度差分析,静电势分析,Bader 电荷分析,态密度,能带结构;实践操作。
- 反应路径与分子动力学计算方法(9 学时):NEB 计算方法与操作实践;系综理论,控温方法,输入文件准备,计算过程,结果分析。
- 计算模拟高级工具(9 学时):Shell, Python 编程基础, 原子模拟环境 ASE 基础
同为初学者,水平有限,如有错误还请指出。
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本笔记中,代码块行前有 $
的,表示在终端输入的命令,实际不需要输入 $
符号。
本笔记中的命令的语法表示中:<参数>
表示必须参数,[参数]
表示可选参数,可参考 命令行语法格式中常用符号的含义。
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菜鸡小张,2020 年。